亲自率领官兵追杀败逃的红巾军。其时明玉珍犹如丧家之犬一般只想着逃命，哪里还敢与段功交锋，他手下的红巾军将士也被段功吓破了胆，听到官兵来了便即作鸟兽散。是以段功率领兵马一直追到四川与云南的交界之处，一路上又斩杀了许多红巾军将士，眼看着明玉珍带着残兵败将狼狈逃入蜀中，这才停止追杀，命令诸将收拢兵马，回转昆明城向梁王复命去了。